一、产品介绍
本试剂盒采用Taqman探针荧光定量PCR法,设计专属探针和关键引物,特异性好,灵敏度高,其最低定量限可以达到3fg/μL水平。DNA参考品制备过程与国家标准品制备完全一致,因此纯度高,无蛋白及离子干扰,经国家标准品浓度校正,保证了待测样品含量检测的准确度。试剂盒提供DNA稀释专用稀释液,单次实验复孔平行性及多次实验间数据重现性好。
二、试剂盒组成
DNA扩增 | |||
组分编号 | 组分名称 | 产品编号/规格 | |
NS-D050T(50T) | NS-D100T(100T) | ||
B1 | 2X qPCR Mix | 0.625mL | 1.25mL |
B2 | Primer & Probe Mix | 100μL | 200μL |
B3 | DNA Dilution Buffer | 2×1.5mL | 4×1.5mL |
B4 | DNA Control (30ng/μL) | 25μL | 50μL |
B5 | RNase-Free H2O | 0.5mL | 1mL |
B6 | 50X ROX Reference Dye(可选) | 0.15ml | 0.3ml |
* ROX参比染料为可选,是否使用取决于使用的仪器。具体可参照PART 6中的说明。
三、实验需要但未提供的耗材及设备
1. | 移液器:5μL-1000μL | 5. | 迷你离心机 |
2. | 1.5/2ml无DNA酶/RNA酶离心管 | 6. | 无DNA酶/RNA酶8联管 |
3. | 200μL无DNA酶/RNA酶PCR管 | 7. | 生物安全柜 |
4. | 涡旋仪 | 8. | 荧光定量qPCR仪 |
四、运输和保存方法
1) 所有组分均干冰运输。
2) 试剂盒需-20℃保存,建议一年内使用完。其中组分B2需避光保存。
3) B2/B3/B4组分在-20℃可以保存两年,B1/B5/B6 组分在-20℃可以保存一年。此外B1/B5/B6 三个组分也可以一起另外购买。
五、实验前准备
1) 使用本试剂前请仔细阅读说明书,所有成分使用前应完全化冻,低速离心,震荡混匀。
2) 从-20℃冰箱取出,将组分B1(2X qPCR Mix)和B6(50X ROX Reference Dye)分别融解,轻轻颠倒(尽量避免产生泡沫),待溶液完全均一后再行使用。注:如B1(2X qPCR Mix)和B6(50X ROX Reference Dye)需一段时间内经常取用,可在2-8度条件下储存3个月。尽量避免反复多次冻融;如解冻后没有使用,须彻底混匀后重新冷冻。
3) B2 (Primer & Probe Mix) and B4 (DNA Control)在使用前混匀时切勿反复吹打,可采用类似清洗管壁方式。注:为减少反复冻融次数和避免污染,建议初次使用时将B4 (DNA Control)分装储存于-20℃。
4) 已融化未使用的B3 (DNA Dilution Buffer)可保存于2-8℃ 7天,若长时间不用,请放置于-20℃。
5) 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作,实验开始前后紫外照射30min以消除环境中潜在的DNA污染源。
6) 由于荧光定量PCR实验有极强的灵敏度,保持工作环境的洁净非常重要,实验开始前建议完全清洁移液器及周边工作环境,移除清理实验过程中用不到的任何物品。
六、操作过程
(一)DNA定量参考品的稀释和标准曲线的制备
1) 将试剂盒中的DNA Control和DNA Dilution Buffer置于冰上完全融化,轻微振荡混匀,低速离心10 sec。
2) 取7支洁净的200μL PCR管,分别标记为S0,S1,S2,S3,S4,S5,S6,每管各加入45μL DNA稀释液。
3) 在标记为S0的PCR管中加入5μL DNA Control (30 ng/μL),即3000pg/μL,快速离心10 sec,振荡5sec,再快速离心10 sec,该浓度可分装置于-20℃短期保存(不超过3个月),使用时避免反复冻融。
4) S1,S2,S3,S4,S5,S6管稀释操作同S0,稀释方法如下:
稀释过程 | 终浓度 | |
S0 | 5μL DNA Control (10ng/μL) + 45 μL DNA Dilution Buffer | 3000pg/μL |
S1 | 5μL S0 + 45μL DNA Dilution Buffer | 300pg/μL |
S2 | 5μL S1 + 45μL DNA Dilution Buffer | 30pg/μL |
S3 | 5μL S2 + 45μL DNA Dilution Buffer | 3pg/μL |
S4 | 5μL S3 + 45μL DNA Dilution Buffer | 300fg/μL |
S5 | 5μL S4 + 45μL DNA Dilution Buffer | 30fg/μL |
S6 | 5μL S5 + 45μL DNA Dilution Buffer | 3fg/μL |
(二)反应体系
组分 | 体积(μL) |
2XqPCR Mix | 12.5 |
Primer&Probe Mix | 2 |
DNA template(control or sample) | 5 |
补加水 | 5.5 |
总体积 | 25 |
【注】:
1) 根据反应孔数计算本次所需Mix混合液总量:Mix混合液=(反应孔数+4)*(12.5+2+5.5)μL(含有4孔的损失量),建议冰上操作。
2) 标准品及待测样本每个浓度做 3 个复孔。上述标准曲线的线性范围适用大多数实验,可根据实际需要适当调整。
3) 实验操作应保持一致。加样完成密封好管子后,请低速离心10 sec将管壁的液体离心收集至管底,再震荡混匀5 sec以上,完全混匀反应液,再低速离心10 sec,如有气泡,需将气泡排尽。
4) 为确保实验结果准确性,建议用1X PBS将溶液中蛋白浓度稀释至1-10mg/ml进行加标回收率实验,确保回收率在50%~150%之间。
5) 几种常见仪器的匹配ROX Reference Dye浓度见下表:
仪器 | 终浓度 |
ABI PRISM 7000/7300/7700/7900HT/Step One等 | 2.5X(例如:1.25μL ROX/25μL体系) |
ABD 7500/7500Fast Stratagene Mx3000P/Mx3005P/Mx4000等 | 0.5X(例如:0.25μL ROX/25μL体系) |
Roche/Bio-Rad/Eppendorf仪器等 | 不用添加 |
(三)扩增程序设置(2步法)
阶段 | 温度(℃) | 时间 | 内容 | 荧光信号采集 | 循环数 |
预变性 | 95℃ | 15 min | 预变性 | 否 | 1 |
PCR反应 | 95℃ | 3 sec | 变性* | 否 |
40
|
60℃ | 30 sec | 退火/延伸* | 是 |
1) PCR反应的预变性条件必须设定为95℃,15min。
2) 选择报告荧光基团为“FAM”,猝灭荧光基团为“TAMRA”。
3) 变性*:请按照仪器使用说明书对不同型号的仪器进行时间。使用ABI 7900HT/7900HT Fast/ViiA 7/StepOnePlus时可设定为1sec。
4) 退火/延伸*:请按照仪器使用说明书对不同型号的仪器进行时间。几种常见仪器的时间设定见下表:
使用ABI 7500 Fast/7900HT/7900HT Fast/ViiA 7/StepOne/StepOnePlus时请设定在30sec |
使用Roche LightCycler/LightCycler 480时请设定在20sec |
使用ABI 7000/7300时请设定在31sec |
使用ABI 7500时请设定在32sec |
七、判定标准
1) 标准曲线:R²>0.99;扩增效率(Eff%):90%≤Eff%≤110%;斜率(Slope):-3.8~-3.1。
2) 加标回收率% = (加标样品测定值-样品测定值) /加标理论值*100%,范围50%-150%。
3) 无模板对照(NTC):即反应体系中用DNA稀释液代替待检测模板,其余成分不变,其检测结果Ct值应为Undetermined或Ct值≥35。
应用: 定量检测重组蛋白表达、中间产物纯化及最终成品中残留DNA的含量
用途: 本试剂盒仅供科研使用,不得用于临床及诊断使用!
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